今はもういないはずの家族と迎える平凡で幸せな朝。その光景に違和感を覚えながらも、受け入れてしまいそうになる太陽。そんな彼の手に突如桜の花が咲き――。
目を覚ました太陽は、不気味に咲く巨大な黒い桜の木から伸びる触手に捕らわれていた。一緒にいた辛三や嫌五も捕らわれ、意識不明。さらに六美や他の兄妹からの通信も途絶えた。状況が分からず灰たち金級スパイも動けない中で、太陽はみんなを助けるために百の元へ向かう！